انتهجت الكلية نظاماً جديداً في تدريب الطلاب ؛ فقد كان الطلاب في الدفعات السابقة يخضعون للتدريبات بالمستسفي في السنتين (الرابعة والخامسة) فقد تغير هذا النظام واصبح التدريب العملي يبدا من الفترة التانية السنة التانية . كما تتعاون الكلية مع وزارة الصحة الإتحادية في تدريب أطباء الإمتياز بالمستشفى ، مما يساهم في الإرتقاء بمستوى أطباءالاسنان وفك الضائقة في تدريبهم بالسودان
